RDfolder是本中心与北京大学生物信息中心联合开发的预测RNA二级结构的Web服务，该工作的相关论文发表于2004年Nucleic Acids Research的Web Server Issue中。RDfolder提供了两种预测RNA二级结构的方法，分别是螺旋区随机堆积方法和螺旋区分布方法。螺旋区随机堆积方法通过Monte Carlo模拟来预测RNA的二级结构；螺旋区分布方法选择在一组结构中按随机堆积方法预测出现次数最多的螺旋区构成二级结构。RDfolder可通过http://rna.cbi.pku.edu.cn使用。